Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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