Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAJC17Q9NVM6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DNAJC17Q9NVM6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms