Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MID1IP1Q9NPA3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms