Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 VN1R35P-201ENST00000428102 693 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 SGO1-211ENST00000452020 1162 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX2-OT-202ENST00000461063 566 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02222-201ENST00000513535 1039 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001180.5-201ENST00000581948 730 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX9-AS1-217ENST00000623935 1563 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms