Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms