Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms