Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms