Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms