Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms