Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms