Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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USP9XQ93008 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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