Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS8Q8N3P4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms