Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms