Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms