Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms