Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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