Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP2Q16527 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms