Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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