Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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