Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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