Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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