Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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