Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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