Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms