Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms