Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CACNA1BQ00975 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms