Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMF1P82094 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMF1P82094 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMF1P82094 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMF1P82094 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms