Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms