Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1P60507 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms