Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CSE1LP55060 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CSE1LP55060 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CSE1LP55060 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CSE1LP55060 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CSE1LP55060 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CSE1LP55060 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CSE1LP55060 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CSE1LP55060 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSE1LP55060 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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CSE1LP55060 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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CSE1LP55060 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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CSE1LP55060 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CSE1LP55060 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CSE1LP55060 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSE1LP55060 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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