Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms