Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR7P32248 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCR7P32248 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms