Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms