Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms