Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCAP28676 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GCAP28676 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GCAP28676 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GCAP28676 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GCAP28676 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms