Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRZ1P23471 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPRZ1P23471 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPRZ1P23471 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRZ1P23471 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRZ1P23471 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRZ1P23471 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRZ1P23471 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRZ1P23471 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PTPRZ1P23471 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRZ1P23471 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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