Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMP3P12645 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms