Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9P02748 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9P02748 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9P02748 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms