Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRPO00253 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRPO00253 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms