Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCC2H7BZ55 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms