Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms