Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms