Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO28Q9NVF7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO28Q9NVF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO28Q9NVF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO28Q9NVF7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO28Q9NVF7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO28Q9NVF7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO28Q9NVF7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO28Q9NVF7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms