Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG4Q9H9E3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms