Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC134Q9H6E4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC134Q9H6E4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC134Q9H6E4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms