Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP4-8Q9BYQ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP4-8Q9BYQ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP4-8Q9BYQ9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP4-8Q9BYQ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 MFAP3L-202ENST00000393702 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 S100Z-202ENST00000513010 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM221A-201ENST00000344962 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00564-201ENST00000567258 1119 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms