Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRX2Q99811 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms