Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP1Q99575 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP1Q99575 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP1Q99575 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP1Q99575 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POP1Q99575 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP1Q99575 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP1Q99575 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP1Q99575 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP1Q99575 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POP1Q99575 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POP1Q99575 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POP1Q99575 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POP1Q99575 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POP1Q99575 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POP1Q99575 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP1Q99575 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP1Q99575 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP1Q99575 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP1Q99575 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP1Q99575 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP1Q99575 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP1Q99575 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POP1Q99575 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POP1Q99575 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POP1Q99575 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POP1Q99575 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POP1Q99575 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
POP1Q99575 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POP1Q99575 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POP1Q99575 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POP1Q99575 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POP1Q99575 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POP1Q99575 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP1Q99575 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP1Q99575 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP1Q99575 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP1Q99575 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP1Q99575 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP1Q99575 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP1Q99575 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP1Q99575 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP1Q99575 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP1Q99575 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP1Q99575 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP1Q99575 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP1Q99575 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP1Q99575 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP1Q99575 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP1Q99575 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP1Q99575 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP1Q99575 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP1Q99575 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP1Q99575 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP1Q99575 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POP1Q99575 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP1Q99575 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POP1Q99575 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POP1Q99575 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POP1Q99575 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POP1Q99575 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POP1Q99575 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POP1Q99575 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POP1Q99575 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POP1Q99575 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POP1Q99575 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POP1Q99575 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POP1Q99575 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POP1Q99575 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POP1Q99575 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POP1Q99575 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POP1Q99575 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
POP1Q99575 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP1Q99575 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP1Q99575 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP1Q99575 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP1Q99575 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP1Q99575 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP1Q99575 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP1Q99575 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP1Q99575 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POP1Q99575 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POP1Q99575 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POP1Q99575 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POP1Q99575 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP1Q99575 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP1Q99575 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP1Q99575 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP1Q99575 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP1Q99575 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP1Q99575 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP1Q99575 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP1Q99575 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP1Q99575 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP1Q99575 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP1Q99575 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POP1Q99575 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP1Q99575 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP1Q99575 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP1Q99575 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms