Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD4LQ96PU5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms