Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf49Q96NF6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms